公元1644年四月二十六,李自成帶著殘存的兩萬兵馬逃回北京。由於此時的吳三桂已經投降滿清,山海關門戶已失。李自成自知不是多爾袞和吳三桂的對手,於是便在四月二十九日在北京匆忙稱帝,而後斬殺吳三桂全家34口,最後一把火燒掉了北京城,他本人則是帶著大軍往西安撤退。
此時距離李自成入主北京城僅僅42天時間。
公元1644年七月,李自成在山西,陝北一路部下防線之後,回到了陝西西安。
李自成撤退之後,在吳三桂的引領下,多爾袞打著為崇禎帝復仇的旗號統領滿清八旗入主北京,而後前明被李自成迫害的官員和士紳紛紛投靠滿清。
公元1644年十月,多爾袞在坐穩北京城之後,他命令清軍揮軍西向,攻占山西重鎮太原。
在占領太原之後,多爾袞又兵分兩路,一路讓英親王阿濟格帶著吳三桂,尚可喜等人進攻大同,然後經陝西榆林南下攻取西安;一路命豫親王多鐸帶著孔友德,耿忠明等人從河南懷慶進攻陝西潼關,進而威逼西安。
公元1644年十二月,清軍兩路大軍進入陝西境內,而後李自成率軍與清軍在潼關展開激戰,最終大順軍不敵,潼關失守,李自成又放棄西安,從陝西南田逃到湖北襄陽。
公元1645年三月,兩路清軍在平定陝西大順軍勢力之後,又繼續南下追擊逃到襄陽的李自成,而後李自成又放棄襄陽,南下湖北武昌。而之前占據武昌的張獻忠,此時已經在四川稱帝,建立大西政權。
公元1645年四月,清軍繼續對李自成窮追不捨,李自成不想投靠張獻忠,只能引軍前往江西九江,意圖攻取南京。當李自成走到湖北咸寧的九宮山之時,他本人由於疏忽大意,只帶著20多人前往九宮山探路。最後李自成在九宮山遭遇當地的民團武裝,隨後雙方發生械鬥。
在交戰過程中,李自成被當地民團用鋤頭打死。由此,李自成走完了自己稀里糊塗的一生。