除此之外,功能性消化不良的出現與精神心理因素有關。胃腸道的一切活動,受到神經中樞的支配。一旦長期出現一些不良情緒,就很容易導致胃腸功能發生一些異常。尤其是對於長期抑鬱、焦慮的人群來講,患有功能性消化不良的機率會特別高。